La estructura del CRN consta de tres departamentos:
Departamento para el Desarrollo, Innovación, Experimentación y Formación
Departamento de Observación e Investigación
Departamento de Acreditación y Reconocimiento de Cualificaciones Profesionales
Además cuenta con un Servicio de Información y Orientación que permite informar de las actividades que realiza el Centro y canaliza aquellas demandas, preguntas, sugerencias, etc. que realiza el sector artesanal.